A Modern Warfare 3 a második játék befejezése után folytatódik, amikor az orosz hadsereg megszállja Manhattant (akárcsak a Crysis 2-ben), amihez a Delta Force-t hívják be. Egy Frost nevű tagot alakítunk (a sorozat két újoncának egyikét), aki egy Blackhawkkal repül New York fölé, vagy megpróbál elsüllyeszteni egy orosz tengeralattjárót a Hudson folyóban. Az egyjátékos kampány további tizennégy küldetésének monotonitására sem fogsz panaszkodni: egy orosz szövetségi ügynök vagy a brit SAS tagja szerepében váltogathatsz. Választ kaphatsz a legégetőbb kérdésekre, amelyek az utolsó epizódok óta a fejedben motoszkálnak.