A távoli jövőben felfedeztek egy pszionikus hormont az emberi agyban, amely lehetővé teszi, hogy az emberek érzékeken kívüli képességekkel rendelkezzenek, és megváltoztatja az egész ismert világot. Ahogy az emberiség egy új korszakba lépett, a Mások néven ismert mutánsok ölelték körül, akiknek az emberi agyra fájt a foguk. A mutánsok rendkívül ellenállóak a hagyományos fegyverekkel szemben, ezért különleges lépéseket tesznek az emberiséget fenyegető, korábban nem látott fenyegetés leküzdésére. A Scarlet Nexus egy gyönyörűen stilizált akciójáték, újszerű harcrendszerrel, tele természetfeletti képességekkel.
A pszichikai-kinetikus képességek használata a legnagyobb fegyverré vált szerte a világon. A környezet darabjainak felszedése, összetörése és dobálása, hogy erőteljes támadásokat és kombókat építsünk fel, az egyetlen módja annak, hogy legyőzzük a hatalmas ellenséget.
Az égből leszállt gonosz mutánsok, akik rendkívül ellenállóak a hagyományos támadásokkal és védekezéssel szemben, és elszántak, hogy pusztítást végezzenek a világban. A mutáció miatt állandó gyötrődésben vannak, ezért az élő szervezetek agyát keresik, hogy megszelídítsék őrületüket. Ez a futurisztikus Japán a klasszikus anime és a nyugati sci-fi inspirációit ötvözi a Bran Punknak nevezett műfajban.
A játékban Yuito Sumeragi szerepébe bújhatsz az Other Suppression Force (OSF) csapatából. Fokozatosan felszereled magad pszicho-kinetikus képességeiddel, felfedezed New Himuka futurisztikus városát, és felfedezed a Brain Punk jövő titkait. A történet mögött ugyanazok az emberek állnak, akik a Tales of Vesperia-t is megalkották, így egy összetett, bátorsággal, hősiességgel és interperszonális kapcsolatokkal teli történetre számíthatsz.