A Valkyria Chronicles 4 ugyanabban az időszakban játszódik, mint az eredeti Valkyria Chronicles, de az E osztag teljesen új főszereplőire koncentrál. Claude Wallace parancsnok és gyermekkori barátai útnak indulnak, hogy ebben a kétségbeesett háborúban a szabadságért harcoljanak, de folyamatos csípős hideg, birodalmi katonák hordái és Valkyrie isteni erői állnak köztük és a győzelem között.