A Pet Zombies in 3D-ben felnevelheted saját rothadó humanoid barátaidat, akik élvezik a különleges étrendet (például az agyakat), a fizikai karbantartást (vagy inkább annak hiányát) és a különböző morbid tevékenységeket, amelyek élvezetesebbé teszik élőhalott létüket.


Kísértetjárta temetőkben, elhagyott üzletekben vagy romos katonai bázisokon játszhatsz, gondozhatod vagy könyörtelenül kínozhatod zombijaidat. Minden háromdimenziós környezetet különböző tárgyakkal, kellékekkel és még azzal a zenével is feldobhatsz, amit élőhalott jószágaid a legjobban szeretnek. A játék során új zombikkal találkozhatsz, akiket hozzáadhatsz a saját bandádhoz, és megfelelően eltorzíthatod az arcukat, beállíthatod a bomlási sebességüket, a ruházatukat és minden más tárgyat, amihez játék közben hozzáférsz. A Nintendo 3DS gyorsulásmérőjét használhatod néhány tevékenységhez, például a zombifejek gurításához egy labirintuson keresztül. A játék során különböző trófeákat vagy játékbeli pénzt is szerezhetsz, amit aztán a Zombie Pet Shopban költhetsz el.